Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChkbO55229 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChkbO55229 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChkbO55229 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChkbO55229 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ChkbO55229 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChkbO55229 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms