Protein–RNA interactions for Protein: O55127

Cyp26a1, Cytochrome P450 26A1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26a1O55127 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp26a1O55127 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp26a1O55127 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp26a1O55127 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp26a1O55127 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp26a1O55127 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp26a1O55127 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp26a1O55127 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp26a1O55127 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp26a1O55127 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp26a1O55127 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp26a1O55127 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp26a1O55127 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp26a1O55127 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp26a1O55127 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp26a1O55127 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp26a1O55127 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp26a1O55127 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp26a1O55127 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp26a1O55127 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp26a1O55127 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp26a1O55127 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp26a1O55127 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp26a1O55127 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms