Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syngr1O55100 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syngr1O55100 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syngr1O55100 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syngr1O55100 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syngr1O55100 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syngr1O55100 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syngr1O55100 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syngr1O55100 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syngr1O55100 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syngr1O55100 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syngr1O55100 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syngr1O55100 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syngr1O55100 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syngr1O55100 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syngr1O55100 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syngr1O55100 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syngr1O55100 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syngr1O55100 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syngr1O55100 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syngr1O55100 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syngr1O55100 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Syngr1O55100 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syngr1O55100 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syngr1O55100 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syngr1O55100 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syngr1O55100 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syngr1O55100 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syngr1O55100 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syngr1O55100 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syngr1O55100 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syngr1O55100 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syngr1O55100 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syngr1O55100 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syngr1O55100 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syngr1O55100 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syngr1O55100 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syngr1O55100 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syngr1O55100 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Syngr1O55100 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syngr1O55100 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syngr1O55100 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syngr1O55100 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syngr1O55100 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syngr1O55100 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syngr1O55100 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syngr1O55100 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syngr1O55100 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syngr1O55100 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syngr1O55100 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syngr1O55100 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syngr1O55100 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syngr1O55100 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syngr1O55100 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Syngr1O55100 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Syngr1O55100 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Syngr1O55100 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Syngr1O55100 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Syngr1O55100 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Syngr1O55100 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngr1O55100 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms