Protein–RNA interactions for Protein: O55003

Bnip3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip3O55003 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bnip3O55003 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bnip3O55003 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bnip3O55003 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bnip3O55003 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms