Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pole2O54956 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pole2O54956 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pole2O54956 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pole2O54956 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pole2O54956 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pole2O54956 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pole2O54956 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pole2O54956 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pole2O54956 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pole2O54956 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pole2O54956 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pole2O54956 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pole2O54956 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pole2O54956 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pole2O54956 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pole2O54956 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pole2O54956 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pole2O54956 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pole2O54956 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pole2O54956 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pole2O54956 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pole2O54956 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pole2O54956 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pole2O54956 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pole2O54956 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pole2O54956 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pole2O54956 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pole2O54956 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pole2O54956 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pole2O54956 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pole2O54956 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pole2O54956 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pole2O54956 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pole2O54956 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pole2O54956 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Pole2O54956 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pole2O54956 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pole2O54956 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pole2O54956 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pole2O54956 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pole2O54956 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pole2O54956 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pole2O54956 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pole2O54956 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pole2O54956 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pole2O54956 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pole2O54956 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pole2O54956 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pole2O54956 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pole2O54956 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pole2O54956 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pole2O54956 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pole2O54956 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pole2O54956 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pole2O54956 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pole2O54956 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pole2O54956 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pole2O54956 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pole2O54956 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pole2O54956 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pole2O54956 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pole2O54956 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Pole2O54956 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pole2O54956 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pole2O54956 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pole2O54956 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pole2O54956 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Pole2O54956 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pole2O54956 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pole2O54956 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pole2O54956 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pole2O54956 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pole2O54956 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pole2O54956 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pole2O54956 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pole2O54956 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pole2O54956 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pole2O54956 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pole2O54956 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pole2O54956 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pole2O54956 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pole2O54956 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pole2O54956 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pole2O54956 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pole2O54956 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pole2O54956 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pole2O54956 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pole2O54956 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pole2O54956 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pole2O54956 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pole2O54956 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pole2O54956 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pole2O54956 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pole2O54956 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pole2O54956 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pole2O54956 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pole2O54956 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pole2O54956 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pole2O54956 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms