Protein–RNA interactions for Protein: O54799

Nmbr, Neuromedin-B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbrO54799 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NmbrO54799 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NmbrO54799 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NmbrO54799 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NmbrO54799 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NmbrO54799 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NmbrO54799 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NmbrO54799 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NmbrO54799 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NmbrO54799 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NmbrO54799 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NmbrO54799 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms