Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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DffaO54786 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DffaO54786 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DffaO54786 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DffaO54786 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DffaO54786 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DffaO54786 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DffaO54786 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DffaO54786 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DffaO54786 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DffaO54786 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DffaO54786 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DffaO54786 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
DffaO54786 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
DffaO54786 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DffaO54786 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DffaO54786 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DffaO54786 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DffaO54786 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DffaO54786 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DffaO54786 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DffaO54786 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DffaO54786 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DffaO54786 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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DffaO54786 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DffaO54786 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DffaO54786 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DffaO54786 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DffaO54786 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DffaO54786 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DffaO54786 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DffaO54786 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DffaO54786 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DffaO54786 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DffaO54786 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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DffaO54786 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DffaO54786 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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DffaO54786 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DffaO54786 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DffaO54786 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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DffaO54786 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DffaO54786 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DffaO54786 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DffaO54786 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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DffaO54786 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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DffaO54786 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DffaO54786 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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DffaO54786 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DffaO54786 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DffaO54786 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DffaO54786 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DffaO54786 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DffaO54786 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DffaO54786 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DffaO54786 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DffaO54786 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DffaO54786 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DffaO54786 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DffaO54786 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DffaO54786 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DffaO54786 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DffaO54786 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DffaO54786 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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DffaO54786 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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