Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Bnc1O35914 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms