Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Tnfrsf18O35714 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Tnfrsf18O35714 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Tnfrsf18O35714 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Tnfrsf18O35714 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Tnfrsf18O35714 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Tnfrsf18O35714 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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