Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stag2O35638 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stag2O35638 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stag2O35638 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stag2O35638 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Stag2O35638 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stag2O35638 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stag2O35638 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stag2O35638 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stag2O35638 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stag2O35638 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Stag2O35638 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stag2O35638 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Stag2O35638 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stag2O35638 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms