Protein–RNA interactions for Protein: O35602

Rax, Retinal homeobox protein Rx, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaxO35602 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RaxO35602 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RaxO35602 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RaxO35602 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RaxO35602 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RaxO35602 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RaxO35602 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RaxO35602 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RaxO35602 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RaxO35602 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RaxO35602 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RaxO35602 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RaxO35602 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RaxO35602 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RaxO35602 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RaxO35602 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RaxO35602 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RaxO35602 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RaxO35602 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RaxO35602 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RaxO35602 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RaxO35602 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RaxO35602 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RaxO35602 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RaxO35602 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RaxO35602 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RaxO35602 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RaxO35602 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RaxO35602 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RaxO35602 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RaxO35602 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RaxO35602 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RaxO35602 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RaxO35602 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RaxO35602 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RaxO35602 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RaxO35602 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RaxO35602 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RaxO35602 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RaxO35602 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RaxO35602 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RaxO35602 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RaxO35602 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RaxO35602 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RaxO35602 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RaxO35602 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RaxO35602 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RaxO35602 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RaxO35602 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RaxO35602 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RaxO35602 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RaxO35602 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RaxO35602 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RaxO35602 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RaxO35602 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RaxO35602 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RaxO35602 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RaxO35602 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RaxO35602 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RaxO35602 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RaxO35602 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RaxO35602 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RaxO35602 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RaxO35602 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RaxO35602 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RaxO35602 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RaxO35602 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RaxO35602 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RaxO35602 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RaxO35602 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RaxO35602 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RaxO35602 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RaxO35602 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RaxO35602 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RaxO35602 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RaxO35602 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RaxO35602 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RaxO35602 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RaxO35602 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RaxO35602 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RaxO35602 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RaxO35602 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RaxO35602 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RaxO35602 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RaxO35602 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RaxO35602 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RaxO35602 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RaxO35602 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RaxO35602 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RaxO35602 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RaxO35602 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RaxO35602 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RaxO35602 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RaxO35602 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RaxO35602 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RaxO35602 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RaxO35602 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RaxO35602 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RaxO35602 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RaxO35602 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms