Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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