Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms