Protein–RNA interactions for Protein: O35350

Capn1, Calpain-1 catalytic subunit, mousemouse

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Length 713 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn1O35350 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn1O35350 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn1O35350 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn1O35350 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn1O35350 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn1O35350 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn1O35350 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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