Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Nedd9O35177 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Nedd9O35177 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Nedd9O35177 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Nedd9O35177 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd9O35177 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Nedd9O35177 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Nedd9O35177 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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