Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ArxO35085 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ArxO35085 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ArxO35085 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ArxO35085 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ArxO35085 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ArxO35085 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ArxO35085 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ArxO35085 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ArxO35085 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ArxO35085 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ArxO35085 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ArxO35085 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ArxO35085 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ArxO35085 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ArxO35085 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ArxO35085 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ArxO35085 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ArxO35085 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ArxO35085 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ArxO35085 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ArxO35085 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ArxO35085 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ArxO35085 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ArxO35085 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ArxO35085 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ArxO35085 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ArxO35085 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ArxO35085 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ArxO35085 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ArxO35085 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ArxO35085 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ArxO35085 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ArxO35085 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ArxO35085 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ArxO35085 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
ArxO35085 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ArxO35085 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ArxO35085 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ArxO35085 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ArxO35085 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ArxO35085 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ArxO35085 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ArxO35085 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ArxO35085 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ArxO35085 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ArxO35085 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ArxO35085 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ArxO35085 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ArxO35085 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ArxO35085 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ArxO35085 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ArxO35085 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ArxO35085 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ArxO35085 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ArxO35085 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ArxO35085 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ArxO35085 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ArxO35085 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ArxO35085 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ArxO35085 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ArxO35085 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ArxO35085 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ArxO35085 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ArxO35085 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ArxO35085 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ArxO35085 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ArxO35085 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ArxO35085 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ArxO35085 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ArxO35085 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ArxO35085 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ArxO35085 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ArxO35085 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ArxO35085 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ArxO35085 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ArxO35085 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ArxO35085 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ArxO35085 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ArxO35085 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ArxO35085 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ArxO35085 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ArxO35085 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ArxO35085 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ArxO35085 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ArxO35085 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ArxO35085 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ArxO35085 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ArxO35085 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ArxO35085 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ArxO35085 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ArxO35085 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ArxO35085 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ArxO35085 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ArxO35085 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ArxO35085 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ArxO35085 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ArxO35085 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ArxO35085 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ArxO35085 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms