Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Casq1O09165 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Casq1O09165 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Casq1O09165 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Casq1O09165 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Casq1O09165 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Casq1O09165 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Casq1O09165 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Casq1O09165 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
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