Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EllO08856 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EllO08856 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EllO08856 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EllO08856 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EllO08856 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EllO08856 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EllO08856 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EllO08856 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EllO08856 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EllO08856 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EllO08856 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EllO08856 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EllO08856 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EllO08856 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EllO08856 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EllO08856 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EllO08856 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EllO08856 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EllO08856 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EllO08856 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EllO08856 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EllO08856 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EllO08856 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EllO08856 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EllO08856 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EllO08856 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EllO08856 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EllO08856 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EllO08856 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EllO08856 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EllO08856 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EllO08856 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EllO08856 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EllO08856 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EllO08856 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EllO08856 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EllO08856 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EllO08856 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EllO08856 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EllO08856 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EllO08856 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EllO08856 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EllO08856 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EllO08856 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EllO08856 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EllO08856 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EllO08856 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EllO08856 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EllO08856 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EllO08856 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EllO08856 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EllO08856 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EllO08856 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EllO08856 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EllO08856 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EllO08856 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EllO08856 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EllO08856 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EllO08856 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EllO08856 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EllO08856 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EllO08856 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EllO08856 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EllO08856 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EllO08856 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EllO08856 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EllO08856 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EllO08856 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EllO08856 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EllO08856 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EllO08856 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EllO08856 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EllO08856 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EllO08856 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EllO08856 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EllO08856 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EllO08856 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EllO08856 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EllO08856 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EllO08856 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EllO08856 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EllO08856 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EllO08856 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EllO08856 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EllO08856 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EllO08856 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EllO08856 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EllO08856 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EllO08856 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EllO08856 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EllO08856 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EllO08856 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EllO08856 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
EllO08856 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EllO08856 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EllO08856 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EllO08856 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EllO08856 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EllO08856 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms