Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efna5O08543 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efna5O08543 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna5O08543 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efna5O08543 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efna5O08543 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efna5O08543 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efna5O08543 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms