Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms