Protein–RNA interactions for Protein: L7N1W8

Vmn2r88, Vomeronasal 2, receptor 88, mousemouse

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Length 857 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r88L7N1W8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Vmn2r88L7N1W8 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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Vmn2r88L7N1W8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Vmn2r88L7N1W8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Vmn2r88L7N1W8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Vmn2r88L7N1W8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Vmn2r88L7N1W8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Vmn2r88L7N1W8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms