Protein–RNA interactions for Protein: J3QPZ4

Gm20877, MCG1032490, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20877J3QPZ4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Gm20877J3QPZ4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Gm20877J3QPZ4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Gm20877J3QPZ4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Gm20877J3QPZ4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Gm20877J3QPZ4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Gm20877J3QPZ4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Gm20877J3QPZ4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Gm20877J3QPZ4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Gm20877J3QPZ4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Gm20877J3QPZ4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Gm20877J3QPZ4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gm20877J3QPZ4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20877J3QPZ4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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