Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD5

Gm9602, Predicted gene 9602, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9602J3QPD5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm9602J3QPD5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms