Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm5294J3QP53 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm5294J3QP53 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm5294J3QP53 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm5294J3QP53 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm5294J3QP53 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm5294J3QP53 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm5294J3QP53 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm5294J3QP53 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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