Protein–RNA interactions for Protein: J3QP37

Smim22, MCG1038270, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim22J3QP37 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms