Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Ccdc180J3QNE4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms