Protein–RNA interactions for Protein: J3QMM8

Gm7971, Predicted gene 16429, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7971J3QMM8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Gm7971J3QMM8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm7971J3QMM8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm7971J3QMM8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm7971J3QMM8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm7971J3QMM8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm7971J3QMM8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm7971J3QMM8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Gm7971J3QMM8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm7971J3QMM8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm7971J3QMM8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm7971J3QMM8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Gm7971J3QMM8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm7971J3QMM8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm7971J3QMM8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm7971J3QMM8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm7971J3QMM8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm7971J3QMM8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm7971J3QMM8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
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Gm7971J3QMM8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm7971J3QMM8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm7971J3QMM8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm7971J3QMM8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm7971J3QMM8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm7971J3QMM8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm7971J3QMM8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm7971J3QMM8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm7971J3QMM8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm7971J3QMM8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm7971J3QMM8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm7971J3QMM8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm7971J3QMM8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm7971J3QMM8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm7971J3QMM8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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Gm7971J3QMM8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Gm7971J3QMM8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm7971J3QMM8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm7971J3QMM8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm7971J3QMM8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm7971J3QMM8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm7971J3QMM8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm7971J3QMM8 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm7971J3QMM8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm7971J3QMM8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm7971J3QMM8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Gm7971J3QMM8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Gm7971J3QMM8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm7971J3QMM8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm7971J3QMM8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Gm7971J3QMM8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm7971J3QMM8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm7971J3QMM8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm7971J3QMM8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm7971J3QMM8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm7971J3QMM8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm7971J3QMM8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm7971J3QMM8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm7971J3QMM8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm7971J3QMM8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm7971J3QMM8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm7971J3QMM8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm7971J3QMM8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm7971J3QMM8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm7971J3QMM8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm7971J3QMM8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm7971J3QMM8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm7971J3QMM8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm7971J3QMM8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm7971J3QMM8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm7971J3QMM8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm7971J3QMM8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm7971J3QMM8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm7971J3QMM8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm7971J3QMM8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Gm7971J3QMM8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm7971J3QMM8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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