Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930544D05RikJ3QK56 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930544D05RikJ3QK56 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930544D05RikJ3QK56 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
4930544D05RikJ3QK56 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
4930544D05RikJ3QK56 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930544D05RikJ3QK56 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930544D05RikJ3QK56 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930544D05RikJ3QK56 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930544D05RikJ3QK56 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930544D05RikJ3QK56 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930544D05RikJ3QK56 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930544D05RikJ3QK56 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930544D05RikJ3QK56 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930544D05RikJ3QK56 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
4930544D05RikJ3QK56 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930544D05RikJ3QK56 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930544D05RikJ3QK56 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930544D05RikJ3QK56 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930544D05RikJ3QK56 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930544D05RikJ3QK56 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930544D05RikJ3QK56 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930544D05RikJ3QK56 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930544D05RikJ3QK56 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930544D05RikJ3QK56 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930544D05RikJ3QK56 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930544D05RikJ3QK56 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930544D05RikJ3QK56 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930544D05RikJ3QK56 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930544D05RikJ3QK56 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930544D05RikJ3QK56 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930544D05RikJ3QK56 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930544D05RikJ3QK56 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
4930544D05RikJ3QK56 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930544D05RikJ3QK56 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930544D05RikJ3QK56 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930544D05RikJ3QK56 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
4930544D05RikJ3QK56 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4930544D05RikJ3QK56 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
4930544D05RikJ3QK56 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4930544D05RikJ3QK56 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
4930544D05RikJ3QK56 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4930544D05RikJ3QK56 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4930544D05RikJ3QK56 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4930544D05RikJ3QK56 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
4930544D05RikJ3QK56 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930544D05RikJ3QK56 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930544D05RikJ3QK56 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930544D05RikJ3QK56 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930544D05RikJ3QK56 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930544D05RikJ3QK56 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930544D05RikJ3QK56 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930544D05RikJ3QK56 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930544D05RikJ3QK56 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930544D05RikJ3QK56 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930544D05RikJ3QK56 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930544D05RikJ3QK56 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930544D05RikJ3QK56 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930544D05RikJ3QK56 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930544D05RikJ3QK56 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930544D05RikJ3QK56 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930544D05RikJ3QK56 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930544D05RikJ3QK56 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930544D05RikJ3QK56 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930544D05RikJ3QK56 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930544D05RikJ3QK56 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930544D05RikJ3QK56 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930544D05RikJ3QK56 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930544D05RikJ3QK56 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17■□□□□ 0.31
4930544D05RikJ3QK56 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17■□□□□ 0.31
4930544D05RikJ3QK56 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17■□□□□ 0.31
4930544D05RikJ3QK56 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930544D05RikJ3QK56 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930544D05RikJ3QK56 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930544D05RikJ3QK56 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930544D05RikJ3QK56 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930544D05RikJ3QK56 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17■□□□□ 0.31
4930544D05RikJ3QK56 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
4930544D05RikJ3QK56 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
4930544D05RikJ3QK56 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17■□□□□ 0.31
4930544D05RikJ3QK56 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
4930544D05RikJ3QK56 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
4930544D05RikJ3QK56 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17■□□□□ 0.31
4930544D05RikJ3QK56 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930544D05RikJ3QK56 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
4930544D05RikJ3QK56 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930544D05RikJ3QK56 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930544D05RikJ3QK56 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930544D05RikJ3QK56 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930544D05RikJ3QK56 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930544D05RikJ3QK56 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930544D05RikJ3QK56 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930544D05RikJ3QK56 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930544D05RikJ3QK56 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930544D05RikJ3QK56 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930544D05RikJ3QK56 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930544D05RikJ3QK56 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930544D05RikJ3QK56 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930544D05RikJ3QK56 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930544D05RikJ3QK56 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms