Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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