Protein–RNA interactions for Protein: H3BK29

Vmn2r6, Vomeronasal 2, receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r6H3BK29 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r6H3BK29 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r6H3BK29 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r6H3BK29 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r6H3BK29 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r6H3BK29 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r6H3BK29 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r6H3BK29 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r6H3BK29 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r6H3BK29 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r6H3BK29 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r6H3BK29 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r6H3BK29 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r6H3BK29 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r6H3BK29 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r6H3BK29 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r6H3BK29 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r6H3BK29 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r6H3BK29 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r6H3BK29 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r6H3BK29 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn2r6H3BK29 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn2r6H3BK29 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn2r6H3BK29 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn2r6H3BK29 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn2r6H3BK29 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn2r6H3BK29 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn2r6H3BK29 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn2r6H3BK29 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms