Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf4bG5E8Z2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf4bG5E8Z2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf4bG5E8Z2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf4bG5E8Z2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf4bG5E8Z2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf4bG5E8Z2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf4bG5E8Z2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf4bG5E8Z2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf4bG5E8Z2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf4bG5E8Z2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf4bG5E8Z2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf4bG5E8Z2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf4bG5E8Z2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf4bG5E8Z2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf4bG5E8Z2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf4bG5E8Z2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf4bG5E8Z2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf4bG5E8Z2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf4bG5E8Z2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf4bG5E8Z2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf4bG5E8Z2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf4bG5E8Z2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf4bG5E8Z2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf4bG5E8Z2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf4bG5E8Z2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf4bG5E8Z2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf4bG5E8Z2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf4bG5E8Z2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf4bG5E8Z2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf4bG5E8Z2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf4bG5E8Z2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Taf4bG5E8Z2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Taf4bG5E8Z2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf4bG5E8Z2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms