Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc4lG5E8X2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms