Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r58G3X9U3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms