Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE6

Vmn1r39, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r39G3UWE6 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r39G3UWE6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms