Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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