Protein–RNA interactions for Protein: G3UW31

Vmn1r176, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r176G3UW31 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r176G3UW31 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms