Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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