Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms