Protein–RNA interactions for Protein: F6VWU8

Zfp946, Zinc finger protein 946, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp946F6VWU8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp946F6VWU8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp946F6VWU8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp946F6VWU8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp946F6VWU8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp946F6VWU8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp946F6VWU8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp946F6VWU8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp946F6VWU8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp946F6VWU8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp946F6VWU8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp946F6VWU8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp946F6VWU8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp946F6VWU8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp946F6VWU8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp946F6VWU8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp946F6VWU8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp946F6VWU8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp946F6VWU8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp946F6VWU8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms