Protein–RNA interactions for Protein: F2Z461

Herc6, E3 ISG15--protein ligase Herc6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc6F2Z461 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Herc6F2Z461 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms