Protein–RNA interactions for Protein: E9QAB6

Ptar1, Protein prenyltransferase alpha subunit repeat-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptar1E9QAB6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptar1E9QAB6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptar1E9QAB6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptar1E9QAB6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptar1E9QAB6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptar1E9QAB6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptar1E9QAB6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptar1E9QAB6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptar1E9QAB6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptar1E9QAB6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptar1E9QAB6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptar1E9QAB6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptar1E9QAB6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptar1E9QAB6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptar1E9QAB6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptar1E9QAB6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptar1E9QAB6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms