Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8F9

6030445D17Rik, RIKEN cDNA 6030445D17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030445D17RikE9Q8F9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
6030445D17RikE9Q8F9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms