Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
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Usp31E9Q6Y8 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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