Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms