Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DspE9Q557 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DspE9Q557 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DspE9Q557 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DspE9Q557 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DspE9Q557 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
DspE9Q557 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DspE9Q557 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DspE9Q557 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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