Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms