Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms