Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms