Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt78E9Q0F0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms