Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fndc1E9Q043 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms